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納米孔技術檢測蛋白質新突破,未來可能用于疾病診斷

[內容提要]:對通過納米孔的DNA進行測序,可提供長的讀長,單分子的讀數,并且能夠避免昂貴的熒光標記和費時的擴增步驟。那么,納米孔方法能為蛋白質研究做什么呢?

納米孔技術診斷疾病示意圖

    圍繞納米孔技術這個話題,不知道大家是否有了解過。對通過納米孔的DNA進行測序,可提供長的讀長,單分子的讀數,并且能夠避免昂貴的熒光標記和費時的擴增步驟。那么,納米孔方法能為蛋白質研究做什么呢?

  雖然肉眼看不見,但是這種[much]新的分子生物學技術是強大的。納米孔的直徑約4納米,是一層人造膜上產生的一個納米孔,使研究人員能夠收集一系列測量,對通過這些可滲透的開口的分子進行結構分析。

  納米孔以前用于DNA測序或識別與DNA結合的轉錄因子,通過檢測在每個堿基周圍流動的水溶液的水流變化,揭示穿過這個孔的遺傳物質的秘密。現在,隨著已確立起來的DNA分析,賓夕法尼亞大學的一個研究小組將目光投向了蛋白質。他們新開發了一種方法,于九月二十二日發表在國際納米科學技術領域權威刊物《ACSNano》。

  本文共同作者JefferySaven指出:“我們的方法超過了目前電子學的限制。”

  研究小組所面臨的一個挑戰是,納米孔的開口小于許多蛋白質分子的直徑,他們采用固態納米孔的穩定性,修改開口,以容納較大的蛋白質。Saven說:“納米孔設備的制備和蛋白質易位的測量,確實是具有挑戰性的。”

  一旦他們[much]終制備了合適的納米孔,該研究小組就檢測了蛋白質GCN4-p1,因為這個蛋白質以二聚體和單體的形式出現。納米孔可成功地區分單體——通常有一個非持久性的結構,和二聚體——由螺旋線圈構成。

  有了納米孔,研究人員可以在蛋白質更傾向于自然運轉的環境中,觀察到沒有發生改變的蛋白質。這種方法也不需要大量的蛋白質。鑒于這些優點,納米孔對于表征和確認蛋白質的大小很有價值。納米孔技術[much]終可能應用于疾病的診斷,也應用于個別病人的樣本,因為很多疾病與蛋白質的折疊和結合有關。同時,納米孔結合生物標記檢測技術,以及其用作基因組測序和疾病早期檢測的[much]新研究進展。

 

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